Ansøgere inviteres til et ph.d.-stipendium ved Graduate School of Technical Sciences, Aarhus Universitet, Danmark, inden for Animal and Veterinary Sciences-programmet. Stillingen er ledig fra den 1. januar 2027 eller senere.
Forskningsområde og projektbeskrivelse
Biogasproduktion understøtter overgangen til vedvarende energi og en cirkulær bioøkonomi. Den stigende brug af importeret animalsk biomasse skaber dog forbundne biosikkerhedsgrænseflader mellem europæiske leverandører, international transport, danske modtagelsespunkter, biogasanlæg og nærliggende husdyrproduktion. Dette ph.d.-projekt vil afgøre, om disse veje er mikrobiologisk sandsynlige, og identificere, hvor hygiejnisering og andre biosikkerhedsbarrierer afbryder dem.
Ved hjælp af et risikoinformeret longitudinalt design vil kandidaten udtage prøver fra forbundne afdelinger, herunder indgående biomassetransportkøretøjer, modtagelses- og aflæsningsområder, lokale køretøjer og maskiner, anlægsmiljøer, biomasse før og efter hygiejnisering samt udvalgte udadrettede grænseflader.
Projektet vil kombinere målrettet PCR/RT-qPCR-overvågning for epidemiologisk relevante transnationale husdyrsygdomsagens og andre dyrepatogener med 'long-read shotgun metagenomics', kultur- og levedygtighedsmetoder samt sekventering af udvalgte isolater. Komparative genomiske analyser vil vurdere mikrobiel forbindelse mellem afdelingerne, samtidig med at kodesektion skelnes fra beviser, der er i overensstemmelse med persistens eller overførsel. Fund vil blive integreret med biomasseoprindelse og -type, transporthistorik, sæson og anlægs-/procesforhold.
Kontrollerede eksperimenter vil kvantificere persistens, overførsel og inaktivering under repræsentative transport-, opbevarings-, rengørings-/desinfektions- og procesforhold. Hvor arbejde med agenter med høj konsekvens ikke er muligt, vil passende surrogater, indikatorer eller ikke-infektiøse materialer blive anvendt. Projektet vil levere evidens for mikrobielle farer, resistomer, mobile genetiske elementer, kritiske kontrolpunkter og effektive biosikkerhedsbarrierer i den danske biogassektor.
Kvalifikationer og specifikke kompetencer
Ansøgere til ph.d.-stillingen skal have en relevant kandidatgrad eller en tilsvarende kvalifikation inden for genomik, veterinærvidenskab, mikrobiologi, molekylærbiologi, bioinformatik eller en nært beslægtet disciplin.
Relevant erfaring inden for molekylær mikrobiologi, mikrobiel genomik/metagenomik, kulturbaseret mikrobiologi, bioinformatik eller kvantitativ dataanalyse er en fordel; ansøgere forventes ikke at være eksperter inden for alle områder.
Den succesfulde kandidat bør være motiveret til at kombinere feltprøvetagning, laboratorieeksperimenter og beregningsmæssig analyse; arbejde omhyggeligt under passende biosikkerheds- og kvalitetsprocedurer; samarbejde på tværs af institutioner og med eksterne interessenter; og kommunikere effektivt på skriftligt og mundtligt engelsk. Et kørekort og vilje til at rejse til danske biogasanlæg er en fordel.
Ansættelses- og arbejdssted
Ansættelsesstedet er Aarhus Universitet, og arbejdsstedet er Aarhus Universitet, Institut for Husdyr- og Veterinærvidenskab, Blichers Allé 20, 8830 Tjele, Danmark.
Kontaktpersoner
Ansøgere, der ønsker yderligere information vedrørende ph.d.-stillingen, er velkomne til at kontakte:
- Yaovi Mahuton Gildas Hounmanou, gil@anivet.au.dk (hovedvejleder)
- Anders Dalsgaard, adal@sund.ku.dk (medvejleder)
- Karl Pedersen, karl.pedersen@anivet.au.dk (medvejleder)
For information om ansøgningskrav og obligatoriske bilag, se venligst Technical Sciences - Institut for Husdyr- og Veters ansøgningsvejledning. Hvis svar ikke findes der, kontakt venligst:
Sådan ansøger du
Ansøgningsfristen er den 1. november 2026 kl. 23:59 CET.
Foretrækkes opstart den 1. januar 2027.
Af tekniske årsager skal en projektbeskrivelse uploades. Projektbeskrivelsen skal kopieres fra ovenstående tekst og uploades som en PDF i ansøgningen.
Bemærk venligst:
- Kun dokumenter modtaget inden ansøgningsfristen vil blive evalueret. Dokumenter sendt efter fristen vil derfor ikke blive taget i betragtning.
- Programudvalget kan anmode om yderligere information eller invitere ansøgeren til en samtale.
- Shortlisting vil blive anvendt, hvilket betyder, at evalueringsudvalget kun vil evaluere de mest relevante ansøgninger.
Formalia og lønforhold
Løn og ansættelsesvilkår efter aftale mellem Skatteministeriet og Akademikerne. Du vil blive ansat som videnskabelig medarbejder på løntrin 4-8. Som ph.d.-stipendiat modtager du også et månedligt ikke-pensionsgivende tillæg.
Aarhus Universitets ambition er at være en attraktiv og inspirerende arbejdsplads for alle og at fremme en kultur, hvor alle har mulighed for at trives, opnå og udvikle sig. Technical Sciences - Institut for Husdyr- og Veter anser ligestilling og mangfoldighed som aktiver, og Technical Sciences - Institut for Husdyr- og Veter byder alle ansøgere velkommen.
Ansøgningen skal indsendes via det online rekrutteringssystem, som kan tilgås under 'Sådan ansøger du'.
